More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2661 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 173 aa  340  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  48.53 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  38.93 
 
 		 137 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  34.51 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  37.4 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  43.51 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 		 145 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  37.32 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  34.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  38.93 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.36 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.36 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  25.37 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  29.13 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  29.32 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  43.7 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  29.63 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  29.63 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  29.63 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  26.12 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  23.67 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  28.57 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  29.71 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  26.32 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.52 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.09 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  33.12 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  30 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  34.56 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  29.23 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  24.26 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  24.26 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.79 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  26.36 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  30.08 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  25.9 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  26.43 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  30.08 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  25.71 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  27.07 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  27.07 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>