More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2660 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  44.55 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  45.1 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.41 
 
 		 204 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.28 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.05 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.35 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.1 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.84 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.36 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  43.93 
 
 		 168 aa  148  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  41.67 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.16 
 
 		 181 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  43.63 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  43.63 
 
 		 167 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  44.83 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  42.65 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  42.65 
 
 		 182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  41.9 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  47.92 
 
 		 191 aa  139  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  40.09 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  46.43 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  42.93 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  42.16 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.43 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  44.5 
 
 		 197 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.79 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  41.46 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  40.98 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  40.98 
 
 		 166 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  43.06 
 
 		 182 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.89 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  41.55 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  39.71 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  41.06 
 
 		 164 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.65 
 
 		 162 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  41.18 
 
 		 184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  43.27 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.38 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  42.11 
 
 		 197 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  42.11 
 
 		 197 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  42.11 
 
 		 197 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  39.27 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.63 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  37.75 
 
 		 162 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  43.5 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.06 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.65 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.51 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  42.71 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  40.89 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  40.2 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  37.81 
 
 		 164 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  41.09 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  31.86 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  31.86 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  34.21 
 
 		 201 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  37.13 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  37.13 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  37.5 
 
 		 163 aa  118  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  41.47 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  38.24 
 
 		 163 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.27 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.68 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.68 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  33.16 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  33.16 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  42.29 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.92 
 
 		 168 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  39.49 
 
 		 173 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  36.41 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.33 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  36.92 
 
 		 178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  33.16 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  34.13 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  36.06 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  38.5 
 
 		 164 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  34.92 
 
 		 156 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  39.71 
 
 		 181 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  35.38 
 
 		 173 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  42.93 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  37.24 
 
 		 169 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.22 
 
 		 178 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  33.17 
 
 		 192 aa  111  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  35.38 
 
 		 168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  35.38 
 
 		 168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.92 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  34.8 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  31.19 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  32.39 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  34.18 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  31.37 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  36.95 
 
 		 177 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  34.69 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  35.08 
 
 		 184 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  32.67 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  38.97 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>