81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2640 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  93.21 
 
 
280 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  65.47 
 
 
283 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  61.15 
 
 
282 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  63.1 
 
 
286 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  58.42 
 
 
289 aa  348  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  58.42 
 
 
289 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  60.79 
 
 
284 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  61.42 
 
 
298 aa  345  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  61.34 
 
 
290 aa  340  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  61.15 
 
 
284 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  56.54 
 
 
301 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  56.73 
 
 
288 aa  329  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  60.42 
 
 
286 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  56.23 
 
 
292 aa  327  2e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  56.79 
 
 
296 aa  325  4e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  59.4 
 
 
294 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  57.45 
 
 
296 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  57.45 
 
 
296 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  57.93 
 
 
286 aa  320  1e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  57.09 
 
 
296 aa  320  2e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  57.82 
 
 
292 aa  314  1e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  56.12 
 
 
281 aa  313  2e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  56.2 
 
 
279 aa  309  3e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  54.98 
 
 
285 aa  298  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  54.7 
 
 
302 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  54.34 
 
 
283 aa  294  9e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  53.57 
 
 
283 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  51.65 
 
 
301 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  51.85 
 
 
301 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.31 
 
 
306 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  49.82 
 
 
282 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  51.11 
 
 
286 aa  268  6e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  49.44 
 
 
296 aa  265  9e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  47.94 
 
 
269 aa  253  2e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  45.85 
 
 
297 aa  250  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  42.76 
 
 
299 aa  221  1e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  45.04 
 
 
316 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.63 
 
 
311 aa  197  2e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  31.21 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  33.83 
 
 
284 aa  128  1e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  26.79 
 
 
311 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  27.5 
 
 
329 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  25.54 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  26.43 
 
 
330 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  31.6 
 
 
312 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  25.62 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  25.62 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  25.62 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  27.6 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.82 
 
 
348 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  26.48 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  28.16 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  28.22 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  26.94 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  25.69 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  26.09 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  29.08 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  27.53 
 
 
324 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  22.26 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  30.07 
 
 
311 aa  85.5  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  83.2  4e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  26.35 
 
 
310 aa  82.8  6e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  24.91 
 
 
307 aa  82.4  7e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  26.86 
 
 
306 aa  82.4  8e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.15 
 
 
314 aa  82.4  8e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  25.95 
 
 
325 aa  80.9  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  26.57 
 
 
353 aa  81.3  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  25.52 
 
 
301 aa  81.3  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.46 
 
 
316 aa  80.5  3e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  24.75 
 
 
302 aa  79.7  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.02 
 
 
312 aa  79.3  6e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.2 
 
 
304 aa  76.3  6e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  24.42 
 
 
312 aa  75.5  8e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  23.14 
 
 
312 aa  74.7  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  23.26 
 
 
312 aa  66.2  5e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  21.66 
 
 
318 aa  66.2  6e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.97 
 
 
319 aa  51.6  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  20.94 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  23.89 
 
 
251 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>