87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2497 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  43.92 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.88 
 
 		 326 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  36.49 
 
 		 736 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  32.86 
 
 		 679 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.45 
 
 		 651 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  32.01 
 
 		 681 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  32.05 
 
 		 719 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  29.86 
 
 		 651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  30 
 
 		 718 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  32.31 
 
 		 678 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  30.47 
 
 		 691 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.71 
 
 		 718 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  30.15 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  30.68 
 
 		 722 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  31.21 
 
 		 676 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  30.84 
 
 		 687 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  29.72 
 
 		 672 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  28.99 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  32.61 
 
 		 664 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  30.82 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  30.34 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  30.34 
 
 		 665 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.24 
 
 		 675 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  30.34 
 
 		 665 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.16 
 
 		 731 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  29.17 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  28.14 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  28 
 
 		 661 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  28.01 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  30.5 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  32.49 
 
 		 671 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 708 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  29.79 
 
 		 697 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.26 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  31.47 
 
 		 632 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  33.21 
 
 		 711 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.86 
 
 		 683 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  27.63 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.63 
 
 		 654 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  27.63 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  27.59 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  26.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  26.03 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  26.01 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.84 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  28.34 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  30.26 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.84 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  28.08 
 
 		 708 aa  82.8  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  26.13 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  26.4 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  30.14 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.36 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  28.52 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  27.8 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  27.8 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  26.39 
 
 		 637 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  29.35 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.12 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  29.64 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  26.75 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  28.11 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  26.01 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.69 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  25.64 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  29.52 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  24.54 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  28.42 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  29.05 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  25.27 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  25.27 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.51 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.17 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.2 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  26.69 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  27.15 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  26.78 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  28.04 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  21.51 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  21.92 
 
 		 267 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  28.84 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  34.15 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>