More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2485 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  100 
 
 		 349 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  81.01 
 
 		 317 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  58.42 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  57.38 
 
 		 318 aa  315  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  56.44 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  51.92 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  51.92 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  52.94 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 315 aa  285  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  51.43 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  50 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  51.72 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  54.17 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  49.84 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  50.34 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  51.11 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  50.33 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  49.06 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  46.67 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  48.73 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  46.06 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.92 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  44.05 
 
 		 325 aa  216  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.35 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  50.18 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.22 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  43.96 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  43.96 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  43.96 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.85 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  44.25 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  39.71 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  41.82 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  39.86 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  39.35 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.34 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.77 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.77 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.77 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  39.35 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.77 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  38.04 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.41 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.04 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  40.89 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  38.63 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.04 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.77 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.68 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.15 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  35.49 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.94 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.19 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  42.09 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.3 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  40.43 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.07 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  39.27 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  39.71 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  41.48 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.85 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40 
 
 		 280 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 288 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  40 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  37.68 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.1 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  37.63 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  36.96 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.86 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.82 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 276 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  38.57 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.43 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  36.88 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.04 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>