More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2459 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  25.22 
 
 		 7214 aa  949    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  29.14 
 
 		 3770 aa  1090    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.830211 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.1 
 
 		 6919 aa  923    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.34 
 
 		 3470 aa  1734    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  37.57 
 
 		 2174 aa  1141    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.99 
 
 		 4317 aa  1399    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  27.55 
 
 		 2387 aa  798    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  41.06 
 
 		 5953 aa  2634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.52 
 
 		 6889 aa  2709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.31 
 
 		 2385 aa  1818    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.6 
 
 		 4336 aa  1432    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  38.79 
 
 		 2151 aa  1314    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  32.31 
 
 		 3168 aa  1140    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.51 
 
 		 5929 aa  2080    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  36.64 
 
 		 1753 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.38 
 
 		 3432 aa  1944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.74 
 
 		 4531 aa  2306    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.34 
 
 		 2385 aa  1813    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  25.97 
 
 		 2345 aa  730    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  41.18 
 
 		 2385 aa  1819    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  41.27 
 
 		 2385 aa  1810    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.72 
 
 		 3133 aa  797    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  38.24 
 
 		 3328 aa  1534    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  34.14 
 
 		 4186 aa  964    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.67 
 
 		 3021 aa  1308    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  41.37 
 
 		 1370 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.83 
 
 		 4336 aa  1439    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  39.49 
 
 		 2154 aa  1315    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  32.09 
 
 		 3165 aa  1155    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  36.26 
 
 		 5926 aa  2109    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.91 
 
 		 9498 aa  2548    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.62 
 
 		 5372 aa  1802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.71 
 
 		 5469 aa  1706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.92 
 
 		 13537 aa  2488    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.71 
 
 		 6676 aa  2559    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  43.82 
 
 		 3629 aa  1402    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.27 
 
 		 2867 aa  983    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.65 
 
 		 2791 aa  1180    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.59 
 
 		 1142 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  41.42 
 
 		 3308 aa  2342    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.16 
 
 		 3498 aa  1508    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.27 
 
 		 2033 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  32.94 
 
 		 1436 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  34.08 
 
 		 3287 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  34.18 
 
 		 6274 aa  1643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  37.79 
 
 		 1567 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.85 
 
 		 4239 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.31 
 
 		 6072 aa  2283    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  35.92 
 
 		 4572 aa  2082    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.68 
 
 		 3291 aa  1655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  37.08 
 
 		 5654 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  38.96 
 
 		 4502 aa  1515    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  39.04 
 
 		 1383 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  33.02 
 
 		 2136 aa  840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.05 
 
 		 5422 aa  1670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.33 
 
 		 4882 aa  2212    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.32 
 
 		 3002 aa  1359    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  42.49 
 
 		 1369 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.41 
 
 		 4332 aa  1429    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.62 
 
 		 3219 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.34 
 
 		 2385 aa  1813    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  34.45 
 
 		 4037 aa  1019    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  39.42 
 
 		 1138 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.86 
 
 		 1801 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  37.18 
 
 		 1574 aa  725    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.67 
 
 		 3650 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  33.88 
 
 		 3296 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  67.73 
 
 		 4290 aa  4492    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  100 
 
 		 4489 aa  8746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  58.21 
 
 		 2605 aa  2167    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  85.6 
 
 		 4606 aa  1594    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  34.04 
 
 		 3102 aa  1306    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  33.26 
 
 		 3180 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  35.95 
 
 		 1675 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  25.81 
 
 		 3137 aa  812    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.09 
 
 		 2457 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  35.14 
 
 		 3231 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  37.49 
 
 		 1745 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  34.35 
 
 		 3227 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.7 
 
 		 3176 aa  1128    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 		 3018 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.39 
 
 		 4478 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.35 
 
 		 2352 aa  751    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.01 
 
 		 4342 aa  1391    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  40.87 
 
 		 5149 aa  1456    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  40.36 
 
 		 2189 aa  1295    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  40.41 
 
 		 2448 aa  1438    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  37.33 
 
 		 3524 aa  1768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  35.14 
 
 		 3231 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.31 
 
 		 2151 aa  843    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  37.49 
 
 		 1745 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  34.21 
 
 		 2477 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  37.77 
 
 		 1721 aa  844    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  42.72 
 
 		 1130 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.73 
 
 		 1779 aa  691    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 1449 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.84 
 
 		 3297 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2199 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  38.16 
 
 		 3352 aa  1538    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.89 
 
 		 3294 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>