More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2445 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 473 aa  921    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  51.31 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  42.46 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  38.81 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  40.58 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 395 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  36.97 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  39.07 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.73 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  37.46 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  42.76 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  39.81 
 
 		 343 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  38.8 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.66 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  39.13 
 
 		 389 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  34.92 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 483 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  37.94 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  35.28 
 
 		 392 aa  170  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 		 362 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  32.68 
 
 		 405 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.87 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  33.93 
 
 		 367 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  35.89 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  33.67 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  30.98 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  30.33 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.27 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.78 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  31.41 
 
 		 443 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.8 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 501 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  30.84 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  26.23 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.56 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  30.53 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  34.69 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 499 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  29.03 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 537 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 467 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.37 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  31.62 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.23 
 
 		 490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 486 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  33.67 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  30.38 
 
 		 555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.42 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>