More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2427 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  100 
 
 		 309 aa  610  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  84.31 
 
 		 310 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  75.32 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  73.38 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  70.13 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  70.82 
 
 		 309 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  70.82 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  67.32 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  69.18 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  69.84 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  69.84 
 
 		 309 aa  401  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  68.18 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  70.49 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  68.51 
 
 		 311 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  70.16 
 
 		 311 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  72.88 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  66.45 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  71.48 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  66.23 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  66.89 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  66.24 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  69.41 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  70.82 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  71.8 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  61.44 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  69.74 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  62.83 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  66.78 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  67.1 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  63.9 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  65.8 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  69.61 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  65.36 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  63.02 
 
 		 313 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  64.59 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  63.49 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  63.99 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  69.61 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  63.34 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  61.97 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  63.34 
 
 		 320 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  63.64 
 
 		 320 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  62.17 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  63.34 
 
 		 320 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  64.38 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  64.63 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  62.99 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.05 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  63.31 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  68.52 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  64.8 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  63.73 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.75 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  60 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.97 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.02 
 
 		 322 aa  358  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  63.4 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  63.99 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  67.31 
 
 		 334 aa  356  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  62.66 
 
 		 309 aa  355  5.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  65.03 
 
 		 327 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.77 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  63.84 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  61.06 
 
 		 309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  62.9 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  62.54 
 
 		 309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  61.97 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  59.8 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  59.67 
 
 		 320 aa  351  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.38 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  58.86 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 312 aa  349  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.38 
 
 		 320 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  62.78 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  59.94 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  61.11 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  59.15 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 312 aa  346  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 310 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 310 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  59.68 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  61.36 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.07 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  61.17 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.7 
 
 		 307 aa  343  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  58.82 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.46 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  62.7 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  62.7 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>