82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2395 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  81.67 
 
 
311 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  66.01 
 
 
303 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  62.13 
 
 
328 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  53.44 
 
 
316 aa  331  8e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  51.5 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  35.31 
 
 
309 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7214  sulfotransferase  37.01 
 
 
350 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  46.44 
 
 
304 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  28.12 
 
 
312 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  29.3 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  29.77 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  37.62 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  31.97 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  31.97 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  28.85 
 
 
308 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  33.01 
 
 
295 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  29.41 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  27.99 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  38.28 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  37.12 
 
 
316 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  39.7 
 
 
260 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  26.37 
 
 
295 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  39.7 
 
 
260 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  31.91 
 
 
289 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  33.33 
 
 
293 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.68 
 
 
832 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  30.05 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  30.05 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  34.38 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  31.3 
 
 
681 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  28.19 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  31.39 
 
 
285 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  25.41 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  32.26 
 
 
252 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  33.18 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  30.05 
 
 
676 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  30.26 
 
 
281 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  35.68 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  30.67 
 
 
623 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  27.42 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  33.03 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  30.41 
 
 
247 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  27.62 
 
 
292 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  25.16 
 
 
294 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  27.62 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  30.28 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  28.38 
 
 
274 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  31.17 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  31.63 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  33.11 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  25.64 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  32.47 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  31.72 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.53 
 
 
682 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  29.06 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  30.62 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  29.39 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 
887 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  29.47 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  20.72 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  30.33 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  32.21 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  26.64 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  25 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  27.27 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  24.25 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43022  predicted protein  28.91 
 
 
623 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  27.85 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0455  putative sulfotransferase protein  25.12 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44473  predicted protein  31.75 
 
 
652 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  27.51 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  22.87 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  22.87 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1782  hypothetical protein  25.94 
 
 
302 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  25.96 
 
 
281 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44272  predicted protein  25.42 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297301  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  26.53 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18680  sulfotransferase family protein  31.01 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  25.46 
 
 
725 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2061  sulfotransferase domain-containing protein  23.33 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2197  sulfotransferase domain-containing protein  23.33 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>