More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2392 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  59.61 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  55.45 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  57.6 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  54.11 
 
 		 386 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  53.43 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  55.64 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  53.28 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  54.11 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  54.11 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  54.11 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  52.44 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  53.85 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  49.88 
 
 		 397 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  54.38 
 
 		 368 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  53.37 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  51.1 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  49.01 
 
 		 369 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  50.12 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  50.37 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  51.33 
 
 		 389 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  49.51 
 
 		 370 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  40.84 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  47.24 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  49.75 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  47.14 
 
 		 385 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  45.55 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.98 
 
 		 266 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  53.19 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  41.61 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 		 402 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  38.18 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  40.05 
 
 		 375 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  41.59 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  40.84 
 
 		 360 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.24 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  35.34 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  31.88 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.46 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.46 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.6 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  49.11 
 
 		 356 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  51.14 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.77 
 
 		 370 aa  156  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  52.76 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30.02 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.56 
 
 		 240 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.98 
 
 		 250 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  47.44 
 
 		 225 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.7 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.08 
 
 		 228 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  26.62 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  48.1 
 
 		 306 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  45.71 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.08 
 
 		 233 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  41.45 
 
 		 230 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.17 
 
 		 228 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  40.93 
 
 		 233 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.53 
 
 		 233 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.86 
 
 		 234 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.81 
 
 		 233 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  41.76 
 
 		 230 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  47.53 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.77 
 
 		 242 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  30.82 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.27 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.17 
 
 		 230 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.71 
 
 		 243 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.5 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  43.14 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40 
 
 		 235 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.86 
 
 		 242 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.53 
 
 		 242 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.21 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  44.16 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  30.43 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  43.14 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  43.53 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  41.98 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.39 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  41.14 
 
 		 249 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  40.85 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.42 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  27.67 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.58 
 
 		 235 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  45.57 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.42 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  29.18 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  34.1 
 
 		 526 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.89 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.37 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  40.65 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  39.79 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  39.61 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  39.79 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  41.38 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  41.38 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  40.8 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>