221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2331 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  48.16 
 
 		 506 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  41.33 
 
 		 564 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  44.44 
 
 		 527 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  46.37 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  36.86 
 
 		 544 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  41.29 
 
 		 507 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  43.5 
 
 		 521 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  38.91 
 
 		 525 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  38.64 
 
 		 511 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  38.64 
 
 		 511 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  38.64 
 
 		 511 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  39.03 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  41.8 
 
 		 515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  37.1 
 
 		 500 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  36.33 
 
 		 521 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  43.48 
 
 		 551 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  36.75 
 
 		 515 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  41.15 
 
 		 523 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  40.3 
 
 		 522 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  42.21 
 
 		 542 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  42.4 
 
 		 551 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  38.55 
 
 		 542 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  36.52 
 
 		 545 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  36.5 
 
 		 476 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  38.52 
 
 		 525 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  39.3 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  35.1 
 
 		 524 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  33.73 
 
 		 499 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  41.49 
 
 		 540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  38.46 
 
 		 535 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  36.48 
 
 		 541 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  38.02 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  33.92 
 
 		 504 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  39.58 
 
 		 521 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  36.82 
 
 		 508 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  36.08 
 
 		 504 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  41.56 
 
 		 535 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  38.58 
 
 		 597 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  39.27 
 
 		 557 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  36.73 
 
 		 538 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  35.18 
 
 		 518 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  38.71 
 
 		 533 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  38.71 
 
 		 508 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  36.12 
 
 		 516 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  38.71 
 
 		 508 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 505 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  39.75 
 
 		 505 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  37.94 
 
 		 537 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  38 
 
 		 530 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  39 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  36.57 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  38.77 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  34.94 
 
 		 542 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.3 
 
 		 515 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  36.67 
 
 		 522 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  37.04 
 
 		 643 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  36.03 
 
 		 504 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  34.98 
 
 		 506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  31.2 
 
 		 505 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  35.96 
 
 		 571 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  35.82 
 
 		 520 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  31.91 
 
 		 546 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  31.42 
 
 		 486 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  35.37 
 
 		 518 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  34.98 
 
 		 499 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  35.59 
 
 		 484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  38.2 
 
 		 518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  34.91 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.92 
 
 		 505 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  42.55 
 
 		 521 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  37.79 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  35.22 
 
 		 542 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  36 
 
 		 547 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  32.93 
 
 		 532 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  37.56 
 
 		 527 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  32.3 
 
 		 597 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  32.09 
 
 		 613 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.37 
 
 		 478 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  33.22 
 
 		 750 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  35.9 
 
 		 546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  37.05 
 
 		 536 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  30.88 
 
 		 493 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  30.33 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  33.48 
 
 		 532 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.14 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 486 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 555 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 525 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  35.4 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  30.83 
 
 		 502 aa  99.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 		 480 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08310  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 		 462 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.352249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  34.68 
 
 		 524 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 		 600 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.69 
 
 		 519 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  30.88 
 
 		 517 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  28.69 
 
 		 535 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  28.69 
 
 		 535 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>