More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2300 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 345 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  63.3 
 
 		 279 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  50.37 
 
 		 273 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  50.37 
 
 		 273 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  49.81 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  50 
 
 		 273 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  50.37 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  50.37 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  50.37 
 
 		 273 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  49.81 
 
 		 273 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  50 
 
 		 273 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  59.55 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  59.18 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  55.35 
 
 		 289 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  57.56 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  56.93 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  54.84 
 
 		 290 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  58.74 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  55.02 
 
 		 298 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  53.18 
 
 		 264 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  49.63 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  56.6 
 
 		 296 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  45.72 
 
 		 264 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  53.45 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  56.9 
 
 		 60 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  64.91 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  63.33 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  63.33 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  44.21 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  55.71 
 
 		 900 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  47.73 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  57.38 
 
 		 903 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.3 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  53.25 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  65.52 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  55.17 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  54.69 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  60.71 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  46.51 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.69 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  63.79 
 
 		 1033 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.41 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.56 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  43.96 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  62.07 
 
 		 973 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  43.96 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  58.62 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  48.19 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  44.71 
 
 		 830 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  44.14 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  50.72 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  43.12 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  55.17 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  43 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  56.92 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.62 
 
 		 14916 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  47.89 
 
 		 497 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.05 
 
 		 489 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 		 214 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.73 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  56.14 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 		 204 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.32 
 
 		 745 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  43.53 
 
 		 830 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  58.73 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  57.63 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  40.4 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  42.52 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 447 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  56.25 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.17 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  35.57 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.59 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.06 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  48.05 
 
 		 1831 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  44.21 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.85 
 
 		 525 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  37.14 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.68 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>