286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2273 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  100 
 
 		 548 aa  1046    Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  56.27 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  52.95 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  50.74 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  51.96 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  47.15 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  47.43 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  48.2 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.58 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  44.44 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  47.14 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.19 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  46.73 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  46.73 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  45.88 
 
 		 526 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  46.54 
 
 		 530 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  48.13 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  48.69 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  46.28 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  44.16 
 
 		 541 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  43.65 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  45.9 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  49.89 
 
 		 513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  37.73 
 
 		 541 aa  280  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  35.45 
 
 		 522 aa  276  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.31 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.2 
 
 		 540 aa  180  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.99 
 
 		 553 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.14 
 
 		 530 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.65 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  33.26 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 532 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 556 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.13 
 
 		 543 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 527 aa  133  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  33.12 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.85 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 553 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.34 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.74 
 
 		 543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  29.25 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.79 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  29.56 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.71 
 
 		 546 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.29 
 
 		 542 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.22 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.91 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.99 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  26.82 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.86 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.23 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.31 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 536 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.32 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  30.96 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.97 
 
 		 548 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.8 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.3 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.95 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 545 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.8 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.52 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  32.04 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.39 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.02 
 
 		 543 aa  101  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.54 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.03 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.01 
 
 		 548 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.04 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 535 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 542 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  46.83 
 
 		 266 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  23.88 
 
 		 513 aa  94.4  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  22.57 
 
 		 520 aa  93.6  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 569 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  39.29 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 		 584 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  22.03 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>