61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2270 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  95.69 
 
 		 214 aa  233  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  71.3 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  67.59 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  67.59 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  69.16 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  64.6 
 
 		 169 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  64.55 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  66.36 
 
 		 113 aa  156  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  66.36 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  65.77 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  63.27 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  57.76 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  54.39 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  61.26 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  61.54 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  63.74 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  53.27 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  56.9 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  61.68 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  60.87 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  56.9 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  60.87 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  60.87 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  61.54 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  60.87 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  61.54 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  59.78 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  59.34 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  59.34 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  61.18 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  51.65 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  54.95 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  44.86 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  45.71 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  40.74 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  41.67 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  43.53 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  39.45 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  37.38 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  37.25 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  37.72 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  36.94 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  34.91 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  36.27 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  37.21 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  40.78 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  37.63 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  37.37 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  32.41 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  33.91 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  35.65 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  37.93 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  36.67 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>