30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2212 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  932    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  30.18 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  29.08 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  29.08 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  29.52 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  29.38 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  29.71 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  30.85 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  27.8 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  25.57 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 402 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  34.09 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  30.49 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.25 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  27.24 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  25.5 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  36.72 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  27.34 
 
 		 538 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  23.91 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  31.18 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  27.48 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  34.92 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  30.22 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  38.98 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  33.17 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  31.58 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  28.45 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  31.9 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  29.65 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  33.52 
 
 		 376 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>