37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2190 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  81.33 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  84.06 
 
 		 82 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  87.1 
 
 		 71 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  71.43 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  76.47 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  63.24 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  57.35 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  55.88 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  57.14 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  47.22 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  47.89 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  47.89 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  47.06 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  45.59 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  46.27 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  42.65 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  45.59 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  46.27 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  39.44 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  36.62 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  36.62 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  48.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  36.71 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  41.79 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.64 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 		 194 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  38.18 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.51 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  41.07 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>