More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2189 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2189  sulfatase  100 
 
 
524 aa  1075    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.2172  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  45.06 
 
 
498 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  39.96 
 
 
492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  39.72 
 
 
493 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2114  sulfatase  37.16 
 
 
484 aa  286  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.711307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  35.84 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  39.38 
 
 
513 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3902  sulfatase  36.23 
 
 
522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  38.04 
 
 
534 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11149  conserved hypothetical protein  33.27 
 
 
565 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  32.56 
 
 
474 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08341  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02520)  30.7 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333893  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07634  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
562 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89066 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06820  Arylsulfatase precursor, putative  30.62 
 
 
604 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  29.63 
 
 
461 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  27.76 
 
 
564 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.44 
 
 
535 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.97 
 
 
559 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.72 
 
 
537 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  29.92 
 
 
477 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.39 
 
 
483 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  27.88 
 
 
485 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  26.84 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  27.63 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.12 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  28.24 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 
457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.04 
 
 
474 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.38 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  26.62 
 
 
512 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  25 
 
 
506 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  26.92 
 
 
478 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  24.37 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  26.79 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  31.18 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  28.36 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  26.43 
 
 
487 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.68 
 
 
565 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.72 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  25.43 
 
 
495 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  27.56 
 
 
505 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  29.44 
 
 
510 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  27.78 
 
 
505 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  27.39 
 
 
505 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  23.99 
 
 
537 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  27.18 
 
 
486 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  26.57 
 
 
457 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  29.26 
 
 
517 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.25 
 
 
490 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  22.5 
 
 
520 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  23.92 
 
 
523 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  28.83 
 
 
503 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  29.71 
 
 
501 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  26.46 
 
 
504 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  29.35 
 
 
503 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.71 
 
 
459 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  25.95 
 
 
480 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  29.95 
 
 
493 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  25.36 
 
 
494 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.9 
 
 
506 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  27.42 
 
 
462 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  25.93 
 
 
481 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.34 
 
 
505 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.44 
 
 
492 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.25 
 
 
452 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  25.66 
 
 
489 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  27.98 
 
 
594 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  23.3 
 
 
522 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.03 
 
 
536 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  25.75 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  29.06 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.9 
 
 
516 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.5 
 
 
513 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.23 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.66 
 
 
511 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.68 
 
 
486 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  27.08 
 
 
719 aa  99.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.74 
 
 
501 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  27.74 
 
 
501 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.04 
 
 
502 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.23 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  29.67 
 
 
511 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.58 
 
 
497 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.14 
 
 
497 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.14 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.14 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.79 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  25.59 
 
 
517 aa  97.8  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  21.52 
 
 
511 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.11 
 
 
489 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.79 
 
 
509 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  25.93 
 
 
586 aa  96.7  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  26.88 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  28.86 
 
 
516 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  25.86 
 
 
549 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  25.73 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  28.86 
 
 
516 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25 
 
 
496 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  24.9 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  27.05 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>