More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2181 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
306 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
313 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.39 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
322 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.59 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  33.65 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
255 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 
270 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.9 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.22 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.22 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.2 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  34.2 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  31.16 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.23 
 
 
250 aa  82  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.3 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.51 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  34.2 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.24 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.04 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  32.64 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.79 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  30.88 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.86 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  29.91 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  28.99 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.88 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.84 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  27.69 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  27.87 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  31.84 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.77 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.36 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  28.04 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  31.1 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  30.88 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  27.43 
 
 
402 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  28.89 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.3 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.53 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00367255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.56 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.56 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>