More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2171 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 		 335 aa  651    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  59.26 
 
 		 324 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  59.88 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.46 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  51.61 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  44.91 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  40.57 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  40.17 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  43.87 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.62 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.96 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  43.58 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.77 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  41.45 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  36.75 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.06 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  39.31 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  39.26 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  42.11 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.58 
 
 		 307 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  40.17 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  39.45 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.25 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.25 
 
 		 313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  42.47 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.73 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.92 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  38.71 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  38.71 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.36 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  38.53 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  39.37 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  39.83 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.83 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  36.02 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  37.07 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  37.07 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  38.84 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  39.37 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  36.69 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.41 
 
 		 319 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.66 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  36.69 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  45.86 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  35.34 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  36.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  36.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  36.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  36.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  36.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.56 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  37.54 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  36.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  36.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  36.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  36.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  36.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.03 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  36.13 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  45.27 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  36.13 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.81 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  42.26 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.84 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  45.27 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.35 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.84 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  37.13 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.66 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  39.47 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  38.62 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  35.29 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.19 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  38.1 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  38.39 
 
 		 294 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.25 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  39.66 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  40.41 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.35 
 
 		 334 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  36.39 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  35.86 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.41 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.18 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.34 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  38.6 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.46 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.6 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  35.86 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.65 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.61 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.23 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  42.82 
 
 		 318 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  39.54 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  38.33 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.18 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.89 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.23 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  32.63 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>