More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2156 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  70.33 
 
 
269 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
271 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2905  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.68 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217934  normal  0.0141495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
267 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
267 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.82 
 
 
267 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 
254 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
261 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.9 
 
 
261 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
257 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
257 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
257 aa  204  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  48.13 
 
 
277 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.09 
 
 
256 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  46.78 
 
 
271 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.74 
 
 
279 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  51.74 
 
 
279 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  51.08 
 
 
301 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
307 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
264 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  43.81 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  47.35 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
277 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  48.4 
 
 
259 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.4 
 
 
262 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.4 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  46.4 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.4 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
257 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.18 
 
 
262 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 
310 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
275 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.41 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  42.04 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 
264 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
262 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.18 
 
 
274 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
273 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
282 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.74 
 
 
284 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
270 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 
265 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  48.07 
 
 
257 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 
272 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  45.53 
 
 
254 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
260 aa  191  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
284 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
282 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.92 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.07 
 
 
269 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  49.16 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  47.9 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  43.42 
 
 
261 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
300 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  46.47 
 
 
309 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
273 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
270 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
307 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
275 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
307 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  48.89 
 
 
275 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
307 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
273 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
273 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.72 
 
 
257 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.3 
 
 
272 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
279 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
281 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
279 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
284 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.3 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  38.15 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.68 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 
267 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  46.55 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  46.55 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
296 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>