More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2115 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 511 aa  1019    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  39.29 
 
 		 537 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  38.86 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  38.86 
 
 		 541 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  39.38 
 
 		 551 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  37.4 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  38.15 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  39.39 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  38.31 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.08 
 
 		 550 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 		 560 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  30.42 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.79 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.98 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  32.03 
 
 		 542 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 		 554 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.77 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 587 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 543 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.03 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.24 
 
 		 535 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  30.23 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.74 
 
 		 538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 554 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.29 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 		 565 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 547 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  30.63 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.49 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.29 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 547 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.24 
 
 		 521 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.44 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.44 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.44 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 562 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 540 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.71 
 
 		 524 aa  170  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.74 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 541 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.9 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 538 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  28.76 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.76 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30 
 
 		 550 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 544 aa  156  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 521 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.97 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  28.66 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.34 
 
 		 546 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 532 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.6 
 
 		 510 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 530 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.99 
 
 		 531 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.61 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 531 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.27 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.64 
 
 		 528 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>