More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2028 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
322 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.44 
 
 
330 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.23 
 
 
313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.52 
 
 
313 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.42 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.9 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 
282 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
277 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
350 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.58 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.9 
 
 
274 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.9 
 
 
256 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.67 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 
250 aa  93.2  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 
257 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.66 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  32.83 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  29.95 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 
443 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  28.48 
 
 
261 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.67 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.48 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  32.31 
 
 
257 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.56 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.39 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  29.49 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
270 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.56 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.64 
 
 
472 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.3 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  31.88 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
265 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
400 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  32.79 
 
 
460 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  29.72 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  30.39 
 
 
404 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
259 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
255 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  31.96 
 
 
361 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.45 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  27.63 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  31.08 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.16 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.81 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  33.5 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  30.81 
 
 
265 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.41 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.77 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  28 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  29.69 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.8 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  26.58 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>