More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1976 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1976  amino acid adenylation  100 
 
 
1373 aa  2747  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  42.01 
 
 
3235 aa  578  1e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  47.94 
 
 
2063 aa  566  1e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  41.17 
 
 
2581 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  42.95 
 
 
1870 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  42.63 
 
 
1870 aa  546  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  42.35 
 
 
2883 aa  493  1e-138  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  45.79 
 
 
5953 aa  489  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  44.54 
 
 
6006 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  44.98 
 
 
3328 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  44.83 
 
 
6081 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  39.01 
 
 
3308 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  44.98 
 
 
3352 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  42.92 
 
 
4747 aa  479  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.2 
 
 
4882 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  43.88 
 
 
1129 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  44.53 
 
 
6072 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  41.27 
 
 
3432 aa  471  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  41.32 
 
 
625 aa  468  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 
1336 aa  466  1e-130  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  43.54 
 
 
2820 aa  467  1e-130  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  43.92 
 
 
8915 aa  466  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  42.82 
 
 
4991 aa  463  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  43.8 
 
 
8914 aa  462  1e-128  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  41.87 
 
 
2561 aa  456  1e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  39.49 
 
 
2386 aa  454  1e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  39.73 
 
 
2386 aa  449  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  42.86 
 
 
2439 aa  447  1e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  40.49 
 
 
2385 aa  448  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  42.19 
 
 
1174 aa  446  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  46.23 
 
 
7310 aa  446  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.75 
 
 
2385 aa  446  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.45 
 
 
3498 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  42.51 
 
 
6403 aa  446  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  40.18 
 
 
1393 aa  446  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  40.27 
 
 
2385 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  39.6 
 
 
1093 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.97 
 
 
2385 aa  443  1e-122  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.15 
 
 
2385 aa  441  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  40.12 
 
 
2385 aa  441  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  40.12 
 
 
2385 aa  441  1e-122  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  41.61 
 
 
2187 aa  442  1e-122  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  39.97 
 
 
2385 aa  443  1e-122  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  42.88 
 
 
3629 aa  441  1e-122  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.73 
 
 
2385 aa  441  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  41.67 
 
 
2183 aa  442  1e-122  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.93 
 
 
2033 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  40.35 
 
 
5596 aa  439  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.56 
 
 
1142 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.6 
 
 
627 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  42.11 
 
 
4489 aa  439  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  41.95 
 
 
3470 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.28 
 
 
3925 aa  436  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  37.99 
 
 
6404 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  41.56 
 
 
1153 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  39.22 
 
 
2679 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  36.23 
 
 
3086 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  37.56 
 
 
1470 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  36.14 
 
 
3086 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  37.56 
 
 
1470 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  37.75 
 
 
1833 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  41.26 
 
 
1054 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  41.6 
 
 
1153 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  36.5 
 
 
1556 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.65 
 
 
1786 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  40.79 
 
 
1578 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  36.35 
 
 
1556 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  38.2 
 
 
1518 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  36.6 
 
 
1127 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  42.77 
 
 
1059 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  39.07 
 
 
1839 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  41.77 
 
 
1334 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.04 
 
 
6889 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 
2156 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  43.2 
 
 
5750 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  39.04 
 
 
2971 aa  422  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  42.15 
 
 
3404 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  37.96 
 
 
1525 aa  423  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 
3291 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  43.49 
 
 
1104 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  46.25 
 
 
5467 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  39.16 
 
 
1990 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  42.88 
 
 
6999 aa  420  1e-115  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  43.95 
 
 
1104 aa  418  1e-115  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  38.21 
 
 
5469 aa  419  1e-115  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  38.03 
 
 
1816 aa  420  1e-115  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  34.67 
 
 
1533 aa  420  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  37.84 
 
 
2571 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.25 
 
 
1331 aa  418  1e-115  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  37.84 
 
 
2571 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  36.73 
 
 
1550 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  37.71 
 
 
1518 aa  420  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  36.73 
 
 
2156 aa  418  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  35.67 
 
 
2156 aa  419  1e-115  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.46 
 
 
2791 aa  417  1e-115  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  39.61 
 
 
6676 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.07 
 
 
13537 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  41 
 
 
5213 aa  417  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.01 
 
 
2370 aa  415  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  31.23 
 
 
1439 aa  416  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>