More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1959 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 420 aa  851    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3223  transposase  81.45 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327091  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  51.95 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  51.71 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  51.71 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.37 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.25 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.25 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.25 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.25 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.74 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.63 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.79 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.79 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.79 
 
 		 542 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  51.22 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.79 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.12 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.14 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.42 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.5 
 
 		 408 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.36 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.1 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.1 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.1 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.1 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.1 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.96 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.29 
 
 		 378 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  40.3 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.25 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.56 
 
 		 466 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.78 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  42.02 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.96 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  40.2 
 
 		 392 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  46.69 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2958  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.41 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2317  hypothetical protein  64.6 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097002  normal  0.0149356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.7 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  29.25 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  28.8 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  32.69 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  31.83 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4948  transposase IS111A/IS1328/IS1533  50.81 
 
 		 188 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1457  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 207 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.313121 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.25 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.71 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  30.29 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0506  transposase  46.95 
 
 		 172 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  27.65 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  27.65 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  27.65 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>