85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1905 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
270 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  62.55 
 
 
284 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  41.33 
 
 
264 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  34.57 
 
 
256 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  37.17 
 
 
256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  37.17 
 
 
256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.17 
 
 
258 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.14 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.14 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  27.64 
 
 
211 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.14 
 
 
197 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  27.64 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  39.68 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  27.84 
 
 
197 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  27.05 
 
 
197 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  26.94 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  28.16 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  35.96 
 
 
218 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  31.35 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  33.2 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  29.72 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  35.96 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  36.87 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  29.55 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  31.73 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  31.33 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  34.53 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  35.41 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  32.64 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  31.68 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  29.37 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  33.82 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  32.54 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  32.16 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  34.51 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  32.69 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  32 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  30.37 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  30.69 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  32.61 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  30.94 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.18 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.36 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  27.34 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  32.47 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  30.2 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  32 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.87 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  29.84 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.6 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  35.15 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  30.65 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  34.87 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  31.25 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  32.2 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  29.87 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  34.52 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  29.01 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  34.3 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  29.74 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  29.39 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.91 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  32.11 
 
 
343 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  25.25 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  28.46 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  30.96 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  32.63 
 
 
361 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  31.58 
 
 
361 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  31.03 
 
 
348 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  32.74 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  32 
 
 
249 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  33.33 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  30.35 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  29.49 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  25.58 
 
 
689 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  29.08 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  29.15 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  32.26 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  28.43 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  24.2 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  27.81 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>