More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1862 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  100 
 
 		 365 aa  723    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  42.77 
 
 		 370 aa  282  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  46.69 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  45.72 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  47.11 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  46.27 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  45.18 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  43.73 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  44.65 
 
 		 369 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  43.63 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  43.34 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  43.34 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  43.29 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  41.6 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  42.59 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  42.37 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  44.92 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  44.08 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  45.03 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  45.48 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  41.27 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  43.47 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  44.31 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  41.1 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  44.55 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  38.27 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  41.62 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  42.86 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  41.82 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  40.47 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  37.93 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  40.25 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  38.77 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  39.63 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  38.34 
 
 		 353 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  37.43 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  37.43 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  41.8 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.21 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  33.95 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.11 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  34.87 
 
 		 383 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.53 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  31.94 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  38.59 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 370 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>