67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1833 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  63.59 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.67 
 
 		 356 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.5 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  37.62 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  36.45 
 
 		 197 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.2 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  37.98 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 183 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.89 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 697 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  32.99 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.35 
 
 		 1045 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 		 1039 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  34.56 
 
 		 591 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.62 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.53 
 
 		 855 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.35 
 
 		 573 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.13 
 
 		 616 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.09 
 
 		 817 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  33.59 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 		 713 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  30.3 
 
 		 805 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4085  putative signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.93 
 
 		 613 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.11 
 
 		 952 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 		 722 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 470 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4779  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 141 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  31.01 
 
 		 745 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  46.88 
 
 		 1432 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  29.05 
 
 		 753 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.37 
 
 		 549 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.75 
 
 		 743 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 		 776 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2499  hypothetical protein  38.05 
 
 		 105 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 		 1225 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>