74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1826 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2839  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  87.5 
 
 		 104 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  78.64 
 
 		 104 aa  167  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9123  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.94 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.07 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.94 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4089  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2625  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1828  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.63 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.896202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.89 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.96 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.78 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.16 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.11 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.04 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.71 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.58 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4119  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.08 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.08 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4273  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.08 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.71 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0745  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.63 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0741  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.71 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4549  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  0.300182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.22 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.74 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.18 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.52 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.68 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.87 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.34 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1218  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.5 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.52 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.23 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.77 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.58 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  41.27 
 
 		 225 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  33.85 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.34 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19130  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.7 
 
 		 238 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0088577  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.87 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.47 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1410  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.32 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1418  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.11 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1861  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1537  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0264326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.34 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.64 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579809  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.21 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1768  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.07 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2696  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.26 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  22.92 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2161  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.01 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5000  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.17 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000718198  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1536  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.91 
 
 		 118 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1611  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 		 92 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.871945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.12 
 
 		 235 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  27.66 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  26.04 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0322  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.29 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  32.88 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01754  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase protein  27.55 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.9371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29375  predicted protein  36.73 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.395144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1646  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.88 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000199305  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  23.91 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.23 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>