18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1731 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  275  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  85.71 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  48.09 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  44.53 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  42.42 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  35.92 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  41.8 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  35.51 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  36.92 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  43.21 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  39.55 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  36.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1312  hypothetical protein  31.21 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  40.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8209  hypothetical protein  30.49 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>