57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1646 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  100 
 
 
370 aa  717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  75.55 
 
 
340 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  59.06 
 
 
337 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  58.39 
 
 
337 aa  335  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  56.12 
 
 
373 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  52.27 
 
 
318 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  48.1 
 
 
308 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.49 
 
 
302 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  48.66 
 
 
319 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  47.78 
 
 
314 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  46.1 
 
 
376 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  43.9 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  42.47 
 
 
302 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  46.6 
 
 
303 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  41 
 
 
305 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  41.67 
 
 
303 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  43.87 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  41.61 
 
 
313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  41.61 
 
 
303 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  41.61 
 
 
303 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  41.61 
 
 
303 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  40.75 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  39.53 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  41.24 
 
 
338 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  41.5 
 
 
406 aa  192  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  39.74 
 
 
310 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  40.86 
 
 
304 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  42.05 
 
 
303 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  38.08 
 
 
430 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  38.18 
 
 
305 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  35.53 
 
 
311 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  40.32 
 
 
313 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  39.03 
 
 
313 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  34.53 
 
 
313 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  38.41 
 
 
313 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  35.93 
 
 
338 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  33.89 
 
 
571 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  30.18 
 
 
341 aa  145  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.44 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  28.9 
 
 
445 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  23.88 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.59 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.71 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  23.87 
 
 
456 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.36 
 
 
378 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.48 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  27.18 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.74 
 
 
429 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  22.88 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  28.18 
 
 
458 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  23.25 
 
 
456 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  23.25 
 
 
456 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  29 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.05 
 
 
428 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.63 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.2 
 
 
428 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  29.67 
 
 
457 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>