More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1643 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 534 aa  1036    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 		 631 aa  277  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  55.17 
 
 		 705 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  54.4 
 
 		 703 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  50.89 
 
 		 525 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  55.2 
 
 		 776 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  50.17 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  52.09 
 
 		 528 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.15 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 		 632 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  54.92 
 
 		 659 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 		 674 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  50.72 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 		 503 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.07 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 		 766 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 		 487 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.95 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  47.76 
 
 		 422 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  49.27 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.89 
 
 		 668 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  48.34 
 
 		 411 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 		 556 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  47.04 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  48.06 
 
 		 564 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  49.4 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 		 418 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.26 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 		 660 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  47.21 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 		 659 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50.19 
 
 		 621 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  43.21 
 
 		 675 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.26 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 		 595 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 		 638 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  46.27 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 		 650 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 		 695 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 		 538 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  46.57 
 
 		 962 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 		 855 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 		 535 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  42.03 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  47.2 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 		 532 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 		 554 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 		 553 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  47.56 
 
 		 674 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 		 1029 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 		 296 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  47.97 
 
 		 617 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  41.4 
 
 		 581 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 419 aa  170  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  44.91 
 
 		 493 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.88 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.69 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 		 666 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 		 673 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  38.22 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.48 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  42.08 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 		 646 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.98 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.74 
 
 		 623 aa  152  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 		 757 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.78 
 
 		 668 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 		 264 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35 
 
 		 747 aa  150  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  39.79 
 
 		 1358 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 		 557 aa  150  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.37 
 
 		 659 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 		 691 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 468 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  38.71 
 
 		 574 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  39.46 
 
 		 561 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.98 
 
 		 627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>