More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1590 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  100 
 
 		 384 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  77.69 
 
 		 351 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 357 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  50.52 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 352 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  59.43 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  44.75 
 
 		 396 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  51.17 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  56.14 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  55.75 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  44.75 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  44.5 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  44.5 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  43.46 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  41.47 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  42.15 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.68 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.07 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  51.24 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  49.46 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.77 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  50.18 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  41.04 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  52.82 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  52.82 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  52.82 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.97 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  56.34 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  49.62 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  53.11 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  43.8 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  54 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  44.39 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.71 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  54.66 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.31 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  38.17 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  49.47 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  38.98 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.56 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  38.01 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  46.95 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  50.82 
 
 		 369 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  38.89 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.14 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  46.15 
 
 		 378 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  47.72 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.1 
 
 		 378 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  48.1 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.86 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  47.02 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  44.1 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.25 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.03 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  45.67 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  47.13 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  46.9 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.64 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  46.9 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  39.95 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.18 
 
 		 377 aa  216  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.26 
 
 		 358 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  45.64 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  43.2 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  36.46 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.08 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.1 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.82 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  44.25 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  44.25 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  44.88 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  45.39 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.56 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  45.96 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  45.55 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  46.44 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  45.45 
 
 		 527 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  47.39 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.72 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  47.77 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  45.99 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.59 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>