87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1571 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  769    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  72.11 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  67.63 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  27.17 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  27.96 
 
 		 741 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.38 
 
 		 1119 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  32.17 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  32.17 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  34.53 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  31.74 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  18.86 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  27.43 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.27 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  29.56 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  28.21 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  34.23 
 
 		 1293 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  29.8 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  29.88 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.51 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.09 
 
 		 783 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  33.53 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.31 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  32.23 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  29.08 
 
 		 754 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  20.95 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  28.24 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  21.94 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  30.99 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  29.45 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  27.49 
 
 		 814 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.14 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.14 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 903 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  20.83 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  29.37 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1372  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192872  hitchhiker  0.00513595 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.94 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  32.31 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.21 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  31.53 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>