124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1565 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  100 
 
 		 396 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  80.3 
 
 		 396 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  52.56 
 
 		 402 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  53.05 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  48.45 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  45.27 
 
 		 391 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  38.07 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  39.75 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  38.32 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  37.91 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  36.52 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  32.35 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  27.25 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  29.16 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  27.27 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.22 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  27.39 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  26.56 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  25.13 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  25.5 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  28.37 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  23.72 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  23.61 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  29.01 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  25.82 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  26.46 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  25.37 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  25.42 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  25.38 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  23.08 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  25.42 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  24.1 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  24.25 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  22.25 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  25.92 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  23.86 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  22.66 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  23.1 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  24.12 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  23.66 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  23.91 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  23.88 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  24.05 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  21.69 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  22 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  24.79 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  23.03 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  24.28 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  22.19 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  24.72 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  22.04 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  25.83 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  23.15 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  20.46 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  20.81 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  20.94 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  20.83 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  23.08 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  21.31 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  25 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  24.94 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  22.11 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  23.02 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  22.6 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  22.16 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  22.61 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  22.61 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  18.96 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.3 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  22.14 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  22.93 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  21.34 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  20.54 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  18.3 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  20.81 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  21.74 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  25.49 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  18.63 
 
 		 418 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 		 306 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  23.35 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  24.04 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  22.65 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  23.37 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.1 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.48 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 477 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.24 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>