More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1562 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 463 aa  944    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  69.59 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  55.42 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  55.53 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  54.32 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  47.97 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  43.44 
 
 		 419 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  41.97 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  47.64 
 
 		 392 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  41.22 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 418 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  24.13 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 405 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  26.9 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.19 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 		 383 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 416 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.53 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.09 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.59 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.79 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  31.49 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 904 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.38 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 761 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 859 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.51 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  24.42 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  27.6 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>