127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1522 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 268 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  58.53 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  48.45 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  56.72 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 249 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  48.25 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  50.39 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  56.11 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  47.67 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  48.56 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  54.47 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  51.35 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  51.04 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  42.8 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  50.2 
 
 		 265 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  47.04 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  49.61 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  48.33 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  48.26 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  47.52 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  46.56 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  45.95 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  47.04 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  47.33 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  50 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  45 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  45 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  48.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  45.56 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  45.77 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  49.61 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  49.22 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  49.61 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  49.61 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  44.19 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  52.55 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  46.33 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  45.32 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  48.46 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  48.84 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  47.42 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  46.12 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  45.56 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  46.98 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  42.75 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  45.31 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  45.31 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  42.39 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  46.09 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  41.86 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  40.98 
 
 		 246 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  41.98 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  45.86 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  41.86 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  44.83 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  39.75 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  41.25 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  41.25 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  41.51 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  45.21 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  44.03 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  42.75 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  43.44 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  46.9 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  45.08 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  41.27 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  47.23 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  44.49 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  42.19 
 
 		 242 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  40.66 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  43.41 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  33.71 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  41.8 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  44.57 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  46.9 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  45.95 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  46.09 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  44.53 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  45.6 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  44.58 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  45.68 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  27.66 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  29.66 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  24.91 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  28.72 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  31.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  27.71 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  29.73 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  34.38 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  34.17 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  30.98 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  23 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  29.23 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  28.12 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>