182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1513 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1326 aa  2635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35 
 
 		 1324 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  33.56 
 
 		 1314 aa  519  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  33.46 
 
 		 1309 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.3 
 
 		 1311 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  30.98 
 
 		 838 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  30.82 
 
 		 845 aa  256  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  42.72 
 
 		 1046 aa  240  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1383 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  29.49 
 
 		 1509 aa  221  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  32.24 
 
 		 897 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  30.21 
 
 		 1500 aa  213  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.83 
 
 		 849 aa  211  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  29.48 
 
 		 843 aa  207  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  29.38 
 
 		 900 aa  196  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.07 
 
 		 992 aa  196  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1523 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 1000 aa  191  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  30.73 
 
 		 859 aa  188  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.69 
 
 		 829 aa  164  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1010 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.16 
 
 		 899 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  27.82 
 
 		 934 aa  147  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  25.13 
 
 		 1261 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  31.18 
 
 		 675 aa  139  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1017 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1039 aa  124  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1105 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.11 
 
 		 1056 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 		 1262 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 911 aa  118  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1088 aa  116  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 785 aa  109  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 924 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.07 
 
 		 963 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 953 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.77 
 
 		 828 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  27.46 
 
 		 1488 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 		 1146 aa  96.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.02 
 
 		 1185 aa  96.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 776 aa  95.5  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 837 aa  95.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 		 1050 aa  92.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1068 aa  89  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1283 aa  88.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  26.04 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  28.38 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 		 1288 aa  84.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  28.07 
 
 		 476 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1215 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.79 
 
 		 793 aa  80.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 857 aa  77.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22.25 
 
 		 1128 aa  76.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.77 
 
 		 1328 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 1186 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1550 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.14 
 
 		 841 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.38 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1212 aa  69.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  40.21 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 1424 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.03 
 
 		 1131 aa  67  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 843 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  27.07 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  45.33 
 
 		 888 aa  65.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  33.33 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 1125 aa  65.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  20.18 
 
 		 2413 aa  65.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  39.01 
 
 		 234 aa  63.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  39.68 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  28.65 
 
 		 702 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 885 aa  63.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  60.87 
 
 		 894 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 568 aa  62  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 		 568 aa  62  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.73 
 
 		 911 aa  61.6  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  29.48 
 
 		 432 aa  61.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1404 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 966 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 469 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 284 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  26.75 
 
 		 916 aa  59.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 1136 aa  59.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  25.91 
 
 		 902 aa  58.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  29.33 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  25.75 
 
 		 909 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1017 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  39.6 
 
 		 686 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 254 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1170  cell division inhibitor  46.94 
 
 		 256 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  52.08 
 
 		 429 aa  55.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  27.94 
 
 		 466 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  30.51 
 
 		 1098 aa  55.5  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 481 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  44.07 
 
 		 257 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.69 
 
 		 1475 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  44.07 
 
 		 257 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  20.7 
 
 		 825 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>