183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1508 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  57.07 
 
 
191 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  54.45 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  53.4 
 
 
191 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  53.4 
 
 
191 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  53.61 
 
 
222 aa  206  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  53.4 
 
 
192 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  52.36 
 
 
191 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  50.26 
 
 
191 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  51.31 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  49.74 
 
 
191 aa  194  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  47.89 
 
 
192 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  46.84 
 
 
192 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  46.84 
 
 
192 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  46.84 
 
 
192 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  47.37 
 
 
192 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  48.69 
 
 
191 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  47.64 
 
 
192 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  46.07 
 
 
192 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  46.6 
 
 
192 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  45.55 
 
 
248 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  44.5 
 
 
192 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  43.98 
 
 
191 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  43.46 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  47.89 
 
 
191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  43.46 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  45.79 
 
 
191 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  46.6 
 
 
191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  46.6 
 
 
191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  45.26 
 
 
191 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  43.98 
 
 
192 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  43.46 
 
 
192 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  46.07 
 
 
191 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  43.46 
 
 
191 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  47.78 
 
 
205 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  41.36 
 
 
192 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  46.94 
 
 
194 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  46.6 
 
 
191 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  44.68 
 
 
190 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  46.94 
 
 
194 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  45.03 
 
 
192 aa  174  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  41.88 
 
 
191 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  43.46 
 
 
192 aa  174  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  46.49 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  43.39 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  43.98 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  46.99 
 
 
191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  42.93 
 
 
191 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  44.21 
 
 
191 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  44.44 
 
 
192 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  43.98 
 
 
192 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  44.44 
 
 
192 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  47.62 
 
 
193 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  44.44 
 
 
192 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  43.46 
 
 
192 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  44.44 
 
 
192 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  42.93 
 
 
192 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  43.46 
 
 
191 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  41.49 
 
 
191 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  43.39 
 
 
190 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  46.03 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  43.92 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  39.36 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  41.8 
 
 
192 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  42.33 
 
 
192 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  41.05 
 
 
194 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  41.58 
 
 
194 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
194 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
196 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  41.05 
 
 
196 aa  157  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
194 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
194 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  41.05 
 
 
196 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
194 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  41.05 
 
 
194 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  41.58 
 
 
192 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  41.05 
 
 
192 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  41.05 
 
 
192 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  41.05 
 
 
192 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  38.95 
 
 
194 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  41.88 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  41.88 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  37.44 
 
 
200 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  38.38 
 
 
199 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  37.88 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  41.42 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  41.53 
 
 
198 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  42.08 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  39.16 
 
 
184 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  42.08 
 
 
198 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  41.53 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  41.53 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  36.36 
 
 
200 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  40.98 
 
 
198 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  36.65 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>