16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1502 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  100 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  51.52 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  44.09 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  43.69 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  43.41 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  37.07 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  42.57 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  46.09 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  32.23 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  27.87 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 141 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>