278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1453 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 191 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  83.33 
 
 		 238 aa  272  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.28 
 
 		 252 aa  210  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  62.72 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.41 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.54 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  61.76 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  60.11 
 
 		 185 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.2 
 
 		 224 aa  200  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.05 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.18 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.55 
 
 		 320 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.36 
 
 		 254 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.88 
 
 		 193 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.62 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  56.07 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  60.36 
 
 		 253 aa  189  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  59.88 
 
 		 251 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  56.32 
 
 		 282 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  59.3 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  55.29 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.4 
 
 		 279 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  50.26 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  50.28 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 		 243 aa  177  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  51.41 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  50.28 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  50.28 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.76 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  53.48 
 
 		 205 aa  174  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 241 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.34 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  51.41 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  55.56 
 
 		 229 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.11 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.32 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.53 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  48.77 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.74 
 
 		 243 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.29 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.41 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.06 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  43.87 
 
 		 274 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  42.29 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.53 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  43.83 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.1 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  43.11 
 
 		 221 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.35 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.36 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.15 
 
 		 372 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.15 
 
 		 387 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 534 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.15 
 
 		 387 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 282 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.11 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  36.99 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  38.75 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  35.03 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  32.04 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.8 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.25 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.95 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  39.63 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  41.56 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  35.03 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.42 
 
 		 352 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  37.65 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.71 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  41.35 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.26 
 
 		 394 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  38.65 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  35.12 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  32.95 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  44.12 
 
 		 352 aa  98.2  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.16 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>