59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1451 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5064  peptidase M50  65.07 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0650927  normal  0.0347962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  28.5 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  30.77 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  25.94 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  30.05 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  26.47 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  26.47 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  26.47 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1239  hypothetical protein  35.65 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  25.88 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  26.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  25.88 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  26.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  26.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  26.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  29.06 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  28.08 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  25.45 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  30.77 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  25.75 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  30 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  28.65 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  32.72 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  30.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  23.29 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  30.26 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  27.03 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  26.67 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  25.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  27.39 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  26.04 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  28.31 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  26.49 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  26.11 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  28.08 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  28.95 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  27.54 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  28.19 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  30.1 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  28.25 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  25.97 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  25.86 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  27.51 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  21 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  29.59 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  27.45 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2031  hypothetical protein  27.6 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  25.71 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  25.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  25.95 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  35.42 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  25.79 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  24.89 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  24.89 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  28.48 
 
 		 222 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  27.35 
 
 		 221 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1364  hypothetical protein  24.55 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.789886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  26.82 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>