38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1422 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1422  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00134439  normal  0.136409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5090  hypothetical protein  85.71 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  hitchhiker  0.000638915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1413  hypothetical protein  60.49 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0918909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2877  hypothetical protein  58.44 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1117  hypothetical protein  53.85 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2920  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00113152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0904  protein of unknown function YGGT  53.25 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00960363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1290  protein of unknown function YGGT  53.73 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.735211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2639  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1080  protein of unknown function YGGT  52.7 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3192  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3056  hypothetical protein  48.05 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0864971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3255  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.676354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4005  hypothetical protein  42.17 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22740  YGGT family protein  50 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.584515  normal  0.0326478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6100  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0776287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1577  hypothetical protein  46.05 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2404  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27330  YGGT family protein  48.44 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0138  hemolysin-like protein  40 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0119341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1578  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16500  YGGT family protein  43.42 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14322  normal  0.0963368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12176  transmembrane protein  41.33 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.691227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1601  protein of unknown function YGGT  53.12 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.201823  normal  0.632427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3010  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5756  protein of unknown function YGGT  46.77 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3249  hypothetical protein  41.56 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3311  hypothetical protein  41.56 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0475182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3260  hypothetical protein  41.56 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0615606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3516  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393311  normal  0.0621678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1026  hypothetical protein  39.73 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.249686  decreased coverage  0.00177157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10870  YGGT family protein  50 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0110241  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1118  hypothetical protein  34.62 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.448589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2995  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13530  possible membrane protein  40.3 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3207  hypothetical protein  41.82 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.40439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3433  hypothetical protein  41.82 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500015  hitchhiker  0.00553581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3795  protein of unknown function YGGT  34.55 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261566  normal  0.48751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>