More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1414 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  100 
 
 
530 aa  1011    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  76.17 
 
 
474 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  53.16 
 
 
417 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  51.33 
 
 
441 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1009  cell division protein FtsW  55.11 
 
 
411 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172249  normal  0.019811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  43.2 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  43.2 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  43.2 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0896  cell division protein FtsW  46.98 
 
 
476 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.560244  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  45.01 
 
 
501 aa  319  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1406  cell division protein FtsW  50.12 
 
 
438 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  0.0641122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  47.37 
 
 
417 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  44.05 
 
 
506 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1109  cell division protein FtsW  51.46 
 
 
458 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0900673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4012  cell cycle protein  46.67 
 
 
427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  49.18 
 
 
417 aa  299  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  44.05 
 
 
543 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3264  cell division protein FtsW  43.83 
 
 
536 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3018  cell division protein FtsW  49.33 
 
 
570 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1283  cell division protein FtsW  46.28 
 
 
411 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12184  cell division protein ftsW  45.5 
 
 
524 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000239985  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  46.87 
 
 
539 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27420  cell division-specific peptidoglycan biosynthesis regulator FtsW  47.14 
 
 
504 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130775  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5764  cell division protein FtsW  43.7 
 
 
487 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3200  cell division protein FtsW  48.21 
 
 
443 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380668  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3214  cell cycle protein  42.48 
 
 
519 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0869909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1570  cell division protein FtsW  39.14 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  39.11 
 
 
367 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  39.13 
 
 
420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16580  cell division protein FtsW  41.4 
 
 
452 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13610  cell division protein FtsW  43.85 
 
 
430 aa  240  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.169189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3440  cell cycle protein  43.52 
 
 
487 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10800  cell division membrane protein  42.13 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.42 
 
 
367 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1569  cell division protein FtsW  38.39 
 
 
457 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  39.02 
 
 
365 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  37.57 
 
 
391 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1073  cell division protein FtsW  38.69 
 
 
416 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  40.95 
 
 
375 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  37.57 
 
 
391 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2411  cell cycle protein  44.31 
 
 
436 aa  230  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  38.04 
 
 
423 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34140  cell division membrane protein  42.55 
 
 
432 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  0.168594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  37.43 
 
 
371 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  40.23 
 
 
394 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  36.92 
 
 
432 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22810  cell division protein FtsW  43.46 
 
 
434 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.716468  decreased coverage  0.00888407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  36 
 
 
427 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  37.54 
 
 
365 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  37.92 
 
 
387 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  33.26 
 
 
509 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  42.7 
 
 
364 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2607  cell division protein FtsW  38.15 
 
 
373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  38.24 
 
 
386 aa  217  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  38.59 
 
 
363 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3512  cell division protein FtsW  38.81 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09500  cell division membrane protein  36.99 
 
 
606 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0513587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  36.67 
 
 
374 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  35.16 
 
 
404 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  39.08 
 
 
392 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  36.13 
 
 
425 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  36.22 
 
 
423 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  38.53 
 
 
380 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  38.12 
 
 
372 aa  210  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3428  cell division protein FtsW  39.03 
 
 
409 aa  210  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  35.04 
 
 
368 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  38.08 
 
 
372 aa  209  9e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  37.04 
 
 
359 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.77 
 
 
368 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  36.48 
 
 
423 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  36.76 
 
 
413 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  36.86 
 
 
426 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  38.38 
 
 
413 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  37.01 
 
 
396 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  36.44 
 
 
364 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  37.67 
 
 
393 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  35.61 
 
 
403 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  35.61 
 
 
403 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  35.33 
 
 
403 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  36.86 
 
 
427 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  36 
 
 
415 aa  204  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0820  cell division protein FtsW  36.8 
 
 
427 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  37.25 
 
 
413 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  35.93 
 
 
427 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  35.99 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1595  cell division protein FtsW  46.15 
 
 
407 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.800605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
467 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  35.93 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  36.67 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4064  stage V sporulation protein E  37.18 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  35.68 
 
 
427 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  35.68 
 
 
427 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  35.93 
 
 
427 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  35.04 
 
 
403 aa  200  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  35.93 
 
 
427 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  37.33 
 
 
363 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  36.21 
 
 
363 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  36.94 
 
 
374 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  35.93 
 
 
363 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  36.59 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>