More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1386 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 		 369 aa  732    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  80 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.52 
 
 		 432 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  72.76 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.31 
 
 		 378 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  67.89 
 
 		 370 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  69.54 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.52 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.57 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  66.87 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.57 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  65.83 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  62.1 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  62.1 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  62.1 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.74 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  68.69 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  64.89 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  69.97 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  63.78 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.66 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  65.41 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  66.14 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.59 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  59.08 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  55.72 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.19 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  57.64 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  58.04 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  57.14 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.14 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.54 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  57.56 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.89 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  52.33 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 		 342 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 		 329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  50 
 
 		 315 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  50.33 
 
 		 328 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  49.18 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  52.13 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  50.82 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  48 
 
 		 330 aa  305  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  48.57 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50.79 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  48.42 
 
 		 333 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.35 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.4 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  51.3 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50.95 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  48.55 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  45.54 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 332 aa  289  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 329 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  50.48 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  51.33 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.06 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  51.33 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  51.72 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.81 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  51 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.84 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  51.16 
 
 		 319 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  47.81 
 
 		 326 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  47.81 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  51.16 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  51.16 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  51.5 
 
 		 319 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  46.89 
 
 		 332 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.98 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  47.7 
 
 		 320 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.32 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  48.7 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  47.73 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  51.47 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  48.03 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.02 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  48.7 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  49.02 
 
 		 331 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  49.18 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  48.86 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.7 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  48.86 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  49.35 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  48.53 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  48.53 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  48.53 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19020  MoxR-like ATPase  47.62 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>