More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1368 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  90.44 
 
 		 251 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  74.09 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  72 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  73.17 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  71.14 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  71.14 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  71.14 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  72.65 
 
 		 251 aa  358  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  70 
 
 		 250 aa  358  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  70.8 
 
 		 249 aa  357  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  69.2 
 
 		 249 aa  357  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  70.28 
 
 		 251 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  71.95 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  70.8 
 
 		 249 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  71.54 
 
 		 248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  71.84 
 
 		 251 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  70.33 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  70.73 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  68 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  69.51 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  70.33 
 
 		 249 aa  347  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  68.83 
 
 		 250 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  69.23 
 
 		 250 aa  344  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  71.54 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  68.83 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  70.73 
 
 		 251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  64.98 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  68.7 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  64.9 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  64.23 
 
 		 251 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  62.6 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  64.9 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  58.23 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  61.85 
 
 		 256 aa  284  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  57.32 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  58.06 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  53.23 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  56.5 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  48.59 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  48.18 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  248  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  49 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.81 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  45.49 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  48.41 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  48.15 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  48.58 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  46.91 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.63 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  47.26 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  46.86 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  45.9 
 
 		 243 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  46.8 
 
 		 249 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  47.37 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.6 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  46.77 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.56 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  48.18 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.76 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.97 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.97 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  45.93 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  44.62 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  49.21 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  47.97 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  46.84 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  46.64 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  49.21 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  44.22 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.21 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  46.59 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.41 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  47.6 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  48.18 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  48.18 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>