64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1351 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  44 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  45.83 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  40.29 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  46.27 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  39.26 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  46.81 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  36.88 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  42.45 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  41.78 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  43.97 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  41.01 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  42.47 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  40.15 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  37.88 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  41.43 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  41.48 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  40.44 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.96 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  44.29 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  39.02 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.02 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  29.84 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  43.8 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.19 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.41 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  35.04 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  39.19 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  26.32 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.26 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  28.24 
 
 		 455 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  25.56 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  24.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.44 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  23.31 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.44 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  30.53 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.44 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  30.28 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  24.56 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  24.56 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  24.56 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  27.66 
 
 		 143 aa  40  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>