More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1349 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1957  malto-oligosyltrehalose synthase  47.74 
 
 
774 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3074  maltooligosyl trehalose synthase  48.93 
 
 
820 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
831 aa  1667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  79.66 
 
 
864 aa  1310    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16650  malto-oligosyltrehalose synthase  46.39 
 
 
846 aa  632  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12221  normal  0.105789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13820  maltooligosyl trehalose synthase  46.7 
 
 
860 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1742  malto-oligosyltrehalose synthase  46.16 
 
 
839 aa  612  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0333079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1373  malto-oligosyltrehalose synthase  45.53 
 
 
780 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.424135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1602  malto-oligosyltrehalose synthase  45.19 
 
 
727 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2908  maltooligosyl trehalose synthase  44.43 
 
 
787 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.557464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2794  maltooligosyl trehalose synthase  44.82 
 
 
767 aa  562  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0311674  decreased coverage  0.0000045816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1972  maltooligosyl trehalose synthase  45.52 
 
 
835 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.27486  hitchhiker  0.000139329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2617  maltooligosyl trehalose synthase  42.51 
 
 
776 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5113  malto-oligosyltrehalose synthase  43.03 
 
 
749 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0268  maltooligosyl trehalose synthase  42.3 
 
 
749 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.221794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2269  malto-oligosyltrehalose synthase  42.82 
 
 
794 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0794544  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03980  maltooligosyl trehalose synthase  42 
 
 
824 aa  498  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  38.54 
 
 
918 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  40.78 
 
 
856 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  39.11 
 
 
869 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  37.29 
 
 
948 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3081  malto-oligosyltrehalose synthase  42.4 
 
 
774 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3141  malto-oligosyltrehalose synthase  42.4 
 
 
774 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675938  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3098  malto-oligosyltrehalose synthase  42.4 
 
 
774 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272659  normal  0.0829453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  37.66 
 
 
842 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  37.54 
 
 
842 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  37.97 
 
 
869 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  37.88 
 
 
842 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  37.77 
 
 
842 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  37.54 
 
 
842 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11595  maltooligosyltrehalose synthase treY  42.7 
 
 
765 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  37.74 
 
 
843 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  38.23 
 
 
869 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3632  malto-oligosyltrehalose synthase  41.75 
 
 
762 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2785  malto-oligosyltrehalose synthase  40.72 
 
 
763 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413376  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2979  malto-oligosyltrehalose synthase  38.3 
 
 
772 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  38.25 
 
 
884 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  37.6 
 
 
836 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  37.47 
 
 
873 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  37.21 
 
 
924 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  38.4 
 
 
922 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.05 
 
 
1647 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.77 
 
 
1642 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.1 
 
 
1633 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  35.75 
 
 
879 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  34.3 
 
 
935 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  38.11 
 
 
930 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.63 
 
 
1650 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  33.33 
 
 
1411 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  35.39 
 
 
875 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  38.56 
 
 
996 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.45 
 
 
1646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.69 
 
 
1715 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.45 
 
 
1646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  37 
 
 
942 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  36.86 
 
 
942 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  32.82 
 
 
875 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  41.91 
 
 
913 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  38.43 
 
 
986 aa  402  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  34.16 
 
 
951 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  40.23 
 
 
969 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.87 
 
 
1730 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  39.11 
 
 
955 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  36.59 
 
 
995 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  40.23 
 
 
969 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  33.95 
 
 
952 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  40.23 
 
 
944 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  34.32 
 
 
927 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  35.87 
 
 
994 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
1007 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2807  malto-oligosyltrehalose synthase  33.42 
 
 
732 aa  380  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.212302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  35.42 
 
 
924 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  34.77 
 
 
926 aa  373  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  35.73 
 
 
924 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  37.67 
 
 
1013 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  34.19 
 
 
914 aa  366  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  37.35 
 
 
1007 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  37.61 
 
 
955 aa  366  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.25 
 
 
1662 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  34.29 
 
 
917 aa  364  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  37.07 
 
 
1007 aa  363  9e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  35.52 
 
 
924 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  35.19 
 
 
940 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  37.21 
 
 
1009 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  37.03 
 
 
848 aa  356  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  33.16 
 
 
925 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  33.78 
 
 
994 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.12 
 
 
1673 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  33.83 
 
 
994 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  37.45 
 
 
945 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.65 
 
 
1703 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  34.63 
 
 
1405 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  37.45 
 
 
921 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  35.2 
 
 
944 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  37.45 
 
 
921 aa  330  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  37.13 
 
 
928 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  36.55 
 
 
934 aa  327  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  37.46 
 
 
924 aa  327  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  35.19 
 
 
871 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  39.64 
 
 
939 aa  325  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>