More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1339 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1339  adenylylsulfate kinase  100 
 
 
506 aa  982    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.881911  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5171  adenylylsulfate kinase  64.07 
 
 
606 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0533144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1021  adenylylsulfate kinase  63.51 
 
 
495 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3792  adenylylsulfate kinase  59.72 
 
 
508 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00830426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4172  adenylylsulfate kinase  60.19 
 
 
508 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0210  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  57.35 
 
 
544 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1856  sulfate adenylyltransferase  54.93 
 
 
578 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3137  adenylylsulfate kinase  62.98 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.113923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0065  adenylylsulfate kinase  57.82 
 
 
527 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0425  adenylylsulfate kinase  62.62 
 
 
493 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1013  sulfate adenylyltransferase  35.4 
 
 
570 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  60.31 
 
 
670 aa  230  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0818  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  51.42 
 
 
553 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0255  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.55 
 
 
577 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.537615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0714  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50.94 
 
 
585 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1575  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.55 
 
 
587 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0227  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.55 
 
 
568 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.507724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8587  Adenylylsulfate kinase and related kinase-like protein  62.98 
 
 
409 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.941247  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.59 
 
 
691 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5804  adenylylsulfate kinase  58.22 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  49.77 
 
 
690 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2034  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  49.76 
 
 
571 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000871956  decreased coverage  0.0000299137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0612  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  48.11 
 
 
572 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.398101  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1550  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50 
 
 
569 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3336  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  51.2 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4308  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  49.28 
 
 
569 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18790  adenylylsulfate kinase ApsK  54.91 
 
 
376 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0696  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  49.1 
 
 
557 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0250735  unclonable  0.000000000138306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0539  sulfate adenylyltransferase, putative/adenylylsulfate kinase  49.1 
 
 
557 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1075  adenylylsulfate kinase  60.24 
 
 
200 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277861  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1573  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  41.35 
 
 
582 aa  183  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04769  Sulfate adenylyltransferase (EC 2.7.7.4)(Sulfate adenylate transferase)(SAT)(ATP-sulfurylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12555]  47.87 
 
 
574 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1923  adenylylsulfate kinase  46.63 
 
 
175 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.650575  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4040  adenylylsulfate kinase  47.49 
 
 
181 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212019  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3998  adenylylsulfate kinase  47.49 
 
 
181 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1747  adenylylsulfate kinase  50.85 
 
 
184 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3187  adenylylsulfate kinase  51.69 
 
 
202 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0460618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22650  Adenylyl-sulfate kinase  44.2 
 
 
185 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0967  adenylylsulfate kinase  48.33 
 
 
189 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2826  adenylylsulfate kinase  46.93 
 
 
176 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00115262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0038  adenylylsulfate kinase  46.07 
 
 
185 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1619  adenylylsulfate kinase  53.25 
 
 
229 aa  159  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2355  adenylylsulfate kinase  46.63 
 
 
192 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  53.41 
 
 
462 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  50.86 
 
 
638 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  42.39 
 
 
212 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  50.3 
 
 
205 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  49.1 
 
 
647 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4378  adenylylsulfate kinase  46.39 
 
 
195 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0334  adenylyl-sulfate kinase  42.78 
 
 
195 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.7 
 
 
640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  46.86 
 
 
208 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4450  adenylylsulfate kinase  49.44 
 
 
186 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01951  adenylylsulfate kinase  41.21 
 
 
208 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01841  adenylylsulfate kinase  41.21 
 
 
207 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  47.09 
 
 
644 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1408  adenylylsulfate kinase  48.57 
 
 
181 aa  146  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  45.56 
 
 
198 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03560  phosphoadenosine-phosphosulfate synthase (PAPS) bifunctional enzyme, putative  40.98 
 
 
581 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163154  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3318  OmpA/MotB domain protein  47.7 
 
 
178 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.044435  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0168  adenylylsulfate kinase  41.11 
 
 
211 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01861  adenylylsulfate kinase  41.11 
 
 
207 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2338  adenylyl-sulfate kinase  45.25 
 
 
227 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00543558  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  45.3 
 
 
198 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3184  adenylylsulfate kinase  48.81 
 
 
207 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1758  Adenylyl-sulfate kinase  46.24 
 
 
179 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916937  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  49.7 
 
 
205 aa  143  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0450  adenylylsulfate kinase  49.42 
 
 
260 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2481  adenylylsulfate kinase  47.37 
 
 
179 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  49.1 
 
 
205 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  48.54 
 
 
205 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01194  Adenylyl-sulfate kinase (EC 2.7.1.25)(Adenosine-5'-phosphosulfate kinase)(APS kinase)(ATP adenosine-5'-phosphosulfate 3'-phosphotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92203]  45 
 
 
206 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  43.93 
 
 
203 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  48.5 
 
 
205 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3345  Adenylyl-sulfate kinase  45.51 
 
 
203 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  50.31 
 
 
205 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  43.55 
 
 
633 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  44.32 
 
 
228 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3040  adenylylsulfate kinase  48.5 
 
 
205 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  47.9 
 
 
205 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  47.9 
 
 
205 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  42.2 
 
 
199 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  47.9 
 
 
205 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0858  adenylylsulfate kinase  45.51 
 
 
210 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  42.05 
 
 
201 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6306  adenylylsulfate kinase  47.37 
 
 
187 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0965  adenylylsulfate kinase  47.9 
 
 
205 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  43.09 
 
 
223 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2619  adenylylsulfate kinase  48.52 
 
 
236 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1028  adenylylsulfate kinase  48.52 
 
 
283 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  43.89 
 
 
214 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  45.76 
 
 
209 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  42.78 
 
 
640 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  44.51 
 
 
631 aa  137  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_19676  predicted protein  42.16 
 
 
219 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209882  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  42.77 
 
 
198 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1068  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.57 
 
 
652 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1346  adenylyl-sulfate kinase  41.53 
 
 
197 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  42.29 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  46.2 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>