185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1335 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 471 aa  893    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  75 
 
 		 470 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  50.11 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  48.85 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  44.91 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  46.41 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  48.25 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  44.89 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  48.39 
 
 		 493 aa  299  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  44.57 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  43.69 
 
 		 469 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  43.76 
 
 		 473 aa  282  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  44.37 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  35.76 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  34.33 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  32.33 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  32.55 
 
 		 473 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  44.59 
 
 		 475 aa  256  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  32.26 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.87 
 
 		 474 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  40.09 
 
 		 482 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  44.23 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  40.09 
 
 		 488 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  31.48 
 
 		 473 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  31.69 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  31.69 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  31.69 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  31.62 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  43.46 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  31.26 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  36.02 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  36.9 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  31.72 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  34.46 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  35.11 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  32.84 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  39.62 
 
 		 473 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  35.6 
 
 		 459 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.93 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  40.96 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  37.45 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  30.94 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  35.08 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  28.85 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  28.85 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  35.6 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  26.28 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  26.45 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  26.45 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  38.79 
 
 		 454 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 466 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  26.61 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  26.71 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 466 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  35.14 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  33.62 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  38.05 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  33.7 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  33.7 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  33.62 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  37.37 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  27.86 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  26.71 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  27.31 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.64 
 
 		 472 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.02 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.87 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  30.15 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 471 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.34 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  26.46 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  31.38 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  29.14 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  31.19 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  30.92 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  30.63 
 
 		 502 aa  106  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  27.64 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  29.01 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  29.4 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 482 aa  93.2  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  30.86 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  28.75 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  26.15 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.01 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  23.95 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  25.91 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  26.58 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  25.54 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>