More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1322 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  100 
 
 		 231 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  82.14 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  71.76 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  70.37 
 
 		 223 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  67.59 
 
 		 219 aa  287  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  68.52 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  65.84 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  64.22 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  63.76 
 
 		 229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  59.56 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  57.96 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  62.39 
 
 		 222 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  61.29 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  57.85 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  60 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  60.19 
 
 		 222 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  60.19 
 
 		 222 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  60.19 
 
 		 222 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  61.79 
 
 		 218 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  55.36 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  59.11 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  60 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  57.6 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  59.26 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  59.26 
 
 		 221 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  58.13 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  58.54 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.48 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  56.48 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  53.33 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  46.22 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  45.78 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  47.95 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  49.32 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  48.31 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  38.57 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  36.77 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.55 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  36.27 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  36.27 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.33 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  33.66 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  37.13 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.27 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.55 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  32.27 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.11 
 
 		 443 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  31.28 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  33.02 
 
 		 445 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31 
 
 		 626 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.74 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 		 630 aa  93.2  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.18 
 
 		 450 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.02 
 
 		 450 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  35.23 
 
 		 449 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.5 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 628 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.45 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  32.06 
 
 		 457 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  32.7 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  31.14 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.2 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.27 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.86 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  29.47 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  25.94 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.86 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  31.07 
 
 		 617 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 467 aa  78.6  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  32.21 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.73 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>